mega

mega是一款分子进化遗传分析软件，经常用于分子遗传学方面的研究，支持打开估计替代矩阵，支持估计转换/转换偏差，支持计算MCL替换矩阵，可以编辑序列的数据、进行序列的比对、构建系统发育树和推测对比物种序列间的关联。

1、序列分析

系统发育推论

型号选择

约会和时钟

祖传国家

选择和测试

序列比对

2、统计方法

最大似然

距离方法

普通最小二乘

最大的简约

复合似然

贝叶斯

3、强大的视觉工具

对齐/跟踪编辑器

树探索者

数据探索者

传奇发电机

基因复制向导

时间树向导

1、在下载站下载最新版的软件安装包，双击运行

2、安装进行中，耐心等待即可

如何用MEGA转化为MEGA可以用的格式？

物信息学实验有时候会要求做一些进化树图，但是我们所得到的序列一般都是FASTA格式，如何将FASTA格式转化成MEGA可以使用的格式呢。

1、打开MEGA软件，熟悉MEGA的版面

2、看到左上角的【Align】点击选择【Edit/Build Alignment】接下来会出现一个小窗口，点击【OK】

3、点击完【OK】又会弹出另一个小窗口，需要选择protein 或者DNA，看自己需要，这里演示先选择protein点击之后出现窗口，之后操作在新窗口中进行。

4、按图中箭头指示点击【Edit】再选择【Insert  Sequence From File Ctrl+I】点击之后在文件夹中选择自己要改变的FASTA格式序列，选定之后打开。

5、打开序列我们会看到如下的小窗口，接下来在左上角选择【Date】在子菜单中选择【Export Alignment】【MEGA Format】

6、对刚才打开的文件命名，选择存储位置，命名好之后点击【保存】出现一个小窗口输入和刚才一样的名字进去，点击【OK】就好了，文件格式已转换成功。

如何卸载mega软件?

方法一：打开电脑控制面板>>程序>>程序和功能，在程序和功能面板中找到mega软件，右键点击卸载即可

方法二：安装并打开电脑管家软件，选择进入软件管理选项，点击卸载选项，在列表中找到mega软件，点击卸载即可

方法三：安装并打开360软件管家，在卸载选项的列表中找到mega软件，点击卸载即可